ในช่วงฤดูร้อนปี 2016 แวร์เนอร์ ได้ตัดสินใจย้ายไปร่วมทีม แอร์เบ ไลป์ซิก ซึ่งในฤดูกาลนั้น ไลป์ซิก ถือว่าเปนฤดูกาลที่เกินคาด และประสบความสำเร็จ โดย แวร์เนอร์ มีส่วนสำคัญที่ทำให้ ไลป์ซิก ทีมที่พึ่งเลื่อนชั้นขึ้นมา จบอันดับที่ 2 ในลีก โดยผลงานของ แวร์เนอร์ สามารถยิงได้ 21 ประตูและทำ 6 แอสซิสต์ จากการลงเล่นในลีก 31 นัด จากผลงานอันยอดเยี่ยม ทำให้เจ้าตัวได้รับการเรียกติดทีมชาติ เยอรมัน

ฟอร์มแรงต่อเนื่อง