ดาร์วิน นูนเญซ เกิดที่เมือง อาร์ติกัส ทางตะวันตกเฉียงเหนือของ อุรุกวัย โดยครอบครัวเขานั้นอาศัยอยู่ในบริเวณติดแม่น้ำ ซึ่งมีความเสี่ยงสูงมากที่จะเกิดอุทกภัยในช่วงฤดูฝน ต้องเฝ้าระวังทรัพย์สินกลัวว่าอาจจะสูญหายได้ทุกเวลา และชีวิตในวัยเด็กของเขานั้นต้องเผชิญกับความลำเค็ญเป็นอย่างมาก เนื่องจากมีฐานะที่ยากจน คุณพ่อเป็นคนงานก่อสร้าง คุณแม่ของเขานั้นต้องดิ้นรนเก็บขวดขาย เพื่อแลกกับตังค์ นำตังค์ที่ได้มาเลี้ยงดูตัวเขา และพี่ชายของเขาสิ่งเดียวที่จะขับเคลื่อนชีวิตของ ดาร์วิน แล้วก็ให้หลุดพ้นจากความจนและยากลำบากของเขาคือฟุตบอล

เมื่อตอนเขาอายุ 6 ขวบได้เข้ามาเป็นนักเตะเยาวชนและใช้เวลาฝึกฝนทักษะกีฬาลูกหนังจนเป็นที่ยอมรับของอาคาเดมี่ ปี 2003 ดาร์วินในวัยเพียงแค่ 14 ปี ได้เข้าสู่ทีมเยาวชนของเพนาโรล สโมสรยักษ์ใหญ่ของเมืองหลวงพร้อมกับพี่ชายของเขาเอง แต่ก็เกิดอาการคิดถึงครอบครัวที่อาร์ติกัส จึงขออนุญาตกับทางสโมสรกลับไปใช้ชีวิตที่บ้าน 1 ปี และในปีต่อมานั้นเขากลับไปที่เพนาโรล อีกครั้ง แต่ชีวิตการค้าแข้งของเขาเกือบจะหยุดชะงักเนื่องจากได้รับบาดเจ็บเอ็นหัวเข่าและบริเวณสะเบ้าอย่างรุนแรงจึงจำเป็นต้องพักยาวเกือบ 2 ปี จนทำให้เจ้าตัวอดคิดที่จะเลิกล้มการเป็นนักฟุตบอลอาชีพเลยทีเดียว